Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Runx1Q03347 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms