Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb4Q02738 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb4Q02738 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms