Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms