Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms