Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gjb2Q00977 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms