Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SmsP97355 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SmsP97355 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SmsP97355 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms