Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms