Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SeboxP70368 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SeboxP70368 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms