Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Hoxd13P70217 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Hoxd13P70217 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Hoxd13P70217 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Hoxd13P70217 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Hoxd13P70217 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Hoxd13P70217 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hoxd13P70217 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hoxd13P70217 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hoxd13P70217 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hoxd13P70217 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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