Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl30P62889 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl30P62889 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl30P62889 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl30P62889 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl30P62889 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms