Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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