Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn18P56857 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn18P56857 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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Cldn18P56857 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn18P56857 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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