Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacnb3P54285 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacnb3P54285 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms