Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa6P50704 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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