Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FanccP50652 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FanccP50652 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FanccP50652 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FanccP50652 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FanccP50652 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FanccP50652 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FanccP50652 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FanccP50652 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
FanccP50652 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FanccP50652 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FanccP50652 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms