Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TspoP50637 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TspoP50637 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
TspoP50637 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
TspoP50637 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TspoP50637 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TspoP50637 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms