Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CitP49025 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CitP49025 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CitP49025 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CitP49025 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CitP49025 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms