Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CitP49025 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CitP49025 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CitP49025 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CitP49025 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CitP49025 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CitP49025 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CitP49025 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CitP49025 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CitP49025 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms