Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab11bP46638 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms