Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnfsf9P41274 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnfsf9P41274 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms