Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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LtbP41155 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LtbP41155 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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LtbP41155 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LtbP41155 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms