Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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