Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpardP35396 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpardP35396 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpardP35396 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpardP35396 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpardP35396 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpardP35396 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpardP35396 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpardP35396 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpardP35396 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpardP35396 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PpardP35396 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PpardP35396 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PpardP35396 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PpardP35396 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms