Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxa2P31245 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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