Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cd28P31041 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cd28P31041 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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