Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NapbP28663 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NapbP28663 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NapbP28663 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NapbP28663 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NapbP28663 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NapbP28663 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NapbP28663 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NapbP28663 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NapbP28663 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NapbP28663 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NapbP28663 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NapbP28663 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NapbP28663 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NapbP28663 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NapbP28663 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NapbP28663 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NapbP28663 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NapbP28663 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NapbP28663 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NapbP28663 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NapbP28663 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NapbP28663 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NapbP28663 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NapbP28663 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NapbP28663 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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