Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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