Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2afxP27661 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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