Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja1P23242 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja1P23242 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gja1P23242 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gja1P23242 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja1P23242 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja1P23242 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gja1P23242 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms