Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Fcer1aP20489 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Fcer1aP20489 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Fcer1aP20489 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcer1aP20489 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Fcer1aP20489 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcer1aP20489 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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