Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PdgfaP20033 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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