Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18529 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18529 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18529 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18529 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18529 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18529 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18529 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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P18529 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18529 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18529 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms