Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxb1P17919 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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