Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RhoP15409 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RhoP15409 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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