Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmnb1P14733 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms