Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Vpreb2P13373 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms