Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms