Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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