Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfdp1O88271 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms