Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vamp4O70480 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vamp4O70480 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms