Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syngr1O55100 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr1O55100 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms