Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
CrxO54751 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CrxO54751 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CrxO54751 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CrxO54751 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CrxO54751 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CrxO54751 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CrxO54751 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CrxO54751 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CrxO54751 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CrxO54751 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CrxO54751 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms