Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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