Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Kcnk3O35111 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Kcnk3O35111 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Kcnk3O35111 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Kcnk3O35111 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Kcnk3O35111 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Kcnk3O35111 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
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Kcnk3O35111 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Kcnk3O35111 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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