Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MttpO08601 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
MttpO08601 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MttpO08601 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms