Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3278L7N2D2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3278L7N2D2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms