Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm20939L7N243 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms