Protein–RNA interactions for Protein: K7N693

Gm3043, Predicted gene 10408, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3043K7N693 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3043K7N693 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3043K7N693 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3043K7N693 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3043K7N693 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3043K7N693 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3043K7N693 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3043K7N693 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3043K7N693 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3043K7N693 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3043K7N693 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3043K7N693 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3043K7N693 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3043K7N693 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3043K7N693 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3043K7N693 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3043K7N693 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms