Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms