Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm5225J3QPL3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Gm5225J3QPL3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Gm5225J3QPL3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Gm5225J3QPL3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5225J3QPL3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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