Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm20795J3QP49 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm20795J3QP49 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm20795J3QP49 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm20795J3QP49 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm20795J3QP49 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm20795J3QP49 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm20795J3QP49 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm20795J3QP49 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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